在家酿造方法虽然大同小异，但由于操作过程中卫生情况不够严格，导致很多葡萄酒在酿造过程中出现变质。
自酿葡萄酒很难实现过滤、等酿酒必要的条件，因此，自制葡萄酒好在一年内饮用。葡萄酒里长白毛、酒有异味，说明酒已被杂菌感染了，就不能再喝了，否则会引发疾病。自酿的葡萄酒好在1年内喝完。时间长了口感会变淡，但不会危害身体健康。贮存时好将瓶子斜放，瓶塞受潮膨胀，不透气，避免与空气接触、氧化。将酒放置在0℃左右的温度下更利于贮存。
葡萄酒为什么要横放
葡萄酒好的放置方法，是瓶口向上约30度放置。如果长期放置，每3个月要转动一下瓶身，转动90度。这样做的目的是为了保证瓶塞的湿润。瓶塞如果干燥了的话，其体积会缩小，瓶塞和瓶壁之间的压力减小，多余的空气会进入瓶内，使得酒快速氧化而坏掉。
所以瓶塞要与酒液面接触。当然，接触的太过分也不行，如果放置不当，酒对瓶塞造成压力，酒会过量沁到瓶塞木头里，木头会腐烂。所以用以上方法放置为妥当，既能保证酒液面接触到瓶塞，也不会对瓶塞造成压力。
自酿葡萄酒容易滋生霉菌
用于酿造葡萄酒的葡萄需要成熟度高、无破损、无发霉等迹象的葡萄。葡萄在常温下不易保存，很容易发生霉变，如果新鲜度不高，会使酒中更容易滋生霉菌。所以，自酿葡萄酒的过程中一定要选用新鲜的葡萄，切不可把葡萄买回家存放几天后才开始酿造葡萄酒。
自酿葡萄酒隐藏有害物质
自酿葡萄酒中可能隐藏着甲醇和杂醇油，对身体有一定毒副作用，目前家庭自酿葡萄酒还没有除去甲醇和杂醇油的工艺，所以有人喝完自家的葡萄酒后，会出现肚闷的症状。而且，因为硬件不达标，不能够实现全程封闭式生产，自酿葡萄酒也很难达到卫生标准，有可能存在大肠杆菌超标的情况，从而导致肠胃不适。
自酿葡萄酒发酵时间、温度无法控制
一般家庭自酿葡萄酒一个月时间就开始饮用，但是，正常情况下的葡萄酒酿造，白葡萄酒需要3-4个月的发酵时间，红葡萄酒则需要1-2年的发酵时间，而且发酵温度一般情况下不超过20度。而家庭自酿葡萄酒无法时间和温度。
