葡萄酒的二次发酵是指苹果酸-乳酸发酵，主要是通过细菌的活动将苹果酸转化为乳酸。这个发酵步骤普遍运用于红葡萄酒的发酵中，因此通常发生在酒精发酵之后，所以被称为“二次发酵”。
那么为什么要进行二次发酵呢？在葡萄汁的发酵完成之后得到的是初酿葡萄酒，口感艰涩，酒味浓烈，酸度颇高，容易让人喝醉，需要经过苹果酸乳酸发酵后才能使口感变得更加柔顺。苹果酸乳酸发酵（以下简称“乳酸发酵”）的过程，实际上就是将葡萄酒中的苹果酸（Malicacid）经发酵作用转化成乳酸（Lacticacid）以及二氧化碳的过程。因为苹果酸的刺激性非常强，而乳酸会柔和许多，酸度也相应低很多，所以进行乳酸发酵的意义也正是为了改良、优化葡萄酒口感，并初步分解一些杂醇类物质，减少对人体的危害。
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另外需要注意的是，自酿葡萄酒在启动二次发酵过程时，发酵罐需要密封。乳酸发酵的启动条件非常苛刻，一般家庭可能无法满足这样的条件。二次发酵时要注意一定要将容器装满，以便尽量排出容器内的空气，另外还需要采用带有单通气阀门的容器或者可以进行水密封的容器。在乳酸发酵的过程中会有部分二氧化碳气体产生，而且第一阶段的酒精发酵过程可能并没有完全结束，仍然会有二氧化碳产生，所以在乳酸发酵的过程中，要求容器具有单通气阀门，这样可以及时将容器中产生的二氧化碳气体排除，防止爆炸，同时也可以防止空气直接同葡萄酒接触，防止葡萄酒被氧化。如果条件不允许，可以采用完全密封的容器，但是需要定期进行排气，以免发生爆炸。